Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRAP54198 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRAP54198 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIRAP54198 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIRAP54198 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIRAP54198 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIRAP54198 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRAP54198 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms