Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms