Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TTPAP49638 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TTPAP49638 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TTPAP49638 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TTPAP49638 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TTPAP49638 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTPAP49638 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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