Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF4P48230 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms