Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX2-1P43699 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms