Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms