Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA1P38398 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.1 ms