Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP62P37198 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms