Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCC1P33527 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms