Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLIP1P30622 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms