Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGB2P26583 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGB2P26583 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms