Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRGP23470 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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