Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLP19338 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLP19338 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLP19338 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLP19338 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms