Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD2P0DJD1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD2P0DJD1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms