Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD55P08174 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD55P08174 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD55P08174 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD55P08174 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD55P08174 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD55P08174 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD55P08174 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms