Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTMAP06454 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTMAP06454 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTMAP06454 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTMAP06454 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms