Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3DP05423 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms