Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB1P04280 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB1P04280 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB1P04280 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB1P04280 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRB1P04280 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRB1P04280 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB1P04280 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB1P04280 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB1P04280 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB1P04280 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB1P04280 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB1P04280 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB1P04280 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRB1P04280 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRB1P04280 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRB1P04280 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRB1P04280 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRB1P04280 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms