Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
POLR1AO95602 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1AO95602 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms