Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP2O95045 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP2O95045 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP2O95045 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP2O95045 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP2O95045 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP2O95045 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP2O95045 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP2O95045 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP2O95045 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP2O95045 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
UPP2O95045 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP2O95045 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPP2O95045 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP2O95045 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP2O95045 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP2O95045 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP2O95045 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP2O95045 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP2O95045 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPP2O95045 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms