Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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