Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP3O43295 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP3O43295 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms