Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2O14595 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms