Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIEO00221 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIEO00221 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms