Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRGMA1A4Y4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms