Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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