Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms