Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms