Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms