Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNQ9UQP3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms