Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms