Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN8Q9UBY8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms