Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF7Q9UBF6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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