Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
REREQ9P2R6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms