Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD1BQ9P298 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD1BQ9P298 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIGD1BQ9P298 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HIGD1BQ9P298 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms