Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZDHHC3Q9NYG2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms