Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO28Q9NVF7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO28Q9NVF7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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