Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM1Q9NRU3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM1Q9NRU3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms