Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TULP4Q9NRJ4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms