Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf4Q9NR00 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms