Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms