Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF17Q9BXT8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms