Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms