Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSBP4Q9BWG4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSBP4Q9BWG4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms