Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms