Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYD88Q99836 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms