Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RSF1Q96T23 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSF1Q96T23 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms