Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK5RAP2Q96SN8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK5RAP2Q96SN8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms