Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALS2Q96Q42 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2Q96Q42 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms