Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPNS2Q96L46 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPNS2Q96L46 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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